Expresión de proteínas
Las proteínas de la sangre, también denominadas proteínas plasmáticas, son proteínas presentes en el plasma sanguíneo. Cumplen muchas funciones diferentes, como el transporte de lípidos, hormonas, vitaminas y minerales en la actividad y el funcionamiento del sistema inmunitario. Otras proteínas de la sangre actúan como enzimas, componentes del complemento, inhibidores de la proteasa o precursores de la quina. En contra de la creencia popular, la hemoglobina no es una proteína de la sangre, ya que se transporta dentro de los glóbulos rojos, y no en el suero sanguíneo.
La albúmina sérica representa el 55% de las proteínas de la sangre,[1] contribuye en gran medida a mantener la presión oncótica del plasma y ayuda, como portadora, al transporte de lípidos y hormonas esteroides. Las globulinas constituyen el 38% de las proteínas de la sangre y transportan iones, hormonas y lípidos, ayudando a la función inmunitaria. El fibrinógeno comprende el 7% de las proteínas de la sangre; la conversión del fibrinógeno en fibrina insoluble es esencial para la coagulación de la sangre. El resto de las proteínas plasmáticas (1%) son proteínas reguladoras, como enzimas, proenzimas y hormonas. Todas las proteínas de la sangre se sintetizan en el hígado, excepto las gammaglobulinas[1].
Densidad de la sangre
23:Células presentadoras de antígenos – Presentación de antígenos21:Células B – Respuesta inmunitaria adaptativa43:Células B – Respuesta inmunitaria humoral37:Células B – Transcripción24:Células B – Función desconocida41:Basófilos – Respiración celular46:Basófilos – Unión al ADN38:Basófilos – Función desconocida18:Basófilos – Transporte vesicular45: Eosinófilos – Respuesta inmunitaria innata52:Eosinófilos – Transcripción49:Eosinófilos – Función desconocida36:Células GdT – Respuesta inmunitaria adaptativa5:Granulocitos – Función desconocida16:Células MAIT – Función desconocida25:Monocitos – Respuesta inflamatoria51:Monocitos – Respuesta inmunitaria innata14:Monocitos – Función desconocida28:DCs mieloides – Función desconocida50: Neutrófilos – Senescencia celular33:Neutrófilos – Organización de la cromatina8:Neutrófilos – Respuesta inflamatoria9:Neutrófilos – Respuesta inmunitaria innata1:Neutrófilos – Función mixta15:Células NK – Transcripción48:Células NK – Función desconocida12:No específicos – Procesos celulares básicos27:No específicos – Expresión génica31: No específica – Respuesta inflamatoria26:No específica – Mitocondrias39:No específica – Procesamiento del ARNm44:No específica – Transcripción30:No específica – Traducción47:C.D. plasmocitoides – Plegado de proteínas29:C.D. plasmocitoides – Función desconocida20:Células T – Receptor de células T32:Células T – Función desconocida4:Reglas T – Regulación del ciclo celular35:Reglas T – Función desconocida
Células sanguíneas
En total, reunimos 5.305 conjuntos de estadísticas de resumen de GWAS para biomarcadores sanguíneos [11-13,16-23]. Se realizó una búsqueda sistemática basada en el servicio de búsqueda de ontologías (OLS; www.ebi.ac.uk/ols/index) utilizando R y los paquetes ‘rols’ y ‘gwasrapidd’ entre el 7 y el 27 de julio de 2020. OLS es un repositorio de ontologías biomédicas, como la ontología de genes (GO) o la ontología de factores experimentales (EFO), que incluye una descripción sistemática de muchas variables experimentales. En primer lugar, se determinaron todos los subnodos de la EFO “medidas de proteínas” (EFO:0004747) mediante un proceso iterativo basado en el paquete “rols”. En total, se determinaron 628 ID de EFO únicos. Posteriormente, se identificaron todas las asociaciones genéticas notificadas en el catálogo de GWAS [24] (www.ebi.ac.uk/gwas/) y se vincularon al estudio correspondiente utilizando el paquete ‘gwasrapidd’. Ciento setenta y ocho identificaciones de acceso al catálogo GWAS únicas con estadísticas de resumen disponibles fueron curadas manualmente antes de su inclusión. Para ampliar el conjunto de datos, se incluyeron manualmente los estudios publicados en una fecha posterior y se contactó con el primer y el último autor de los estudios sin estadísticas de resumen disponibles públicamente.
Proteínas séricas totales
Las proteínas de la sangre, también llamadas proteínas del suero, son proteínas que se encuentran en el plasma sanguíneo. Cumplen muchas funciones diferentes, como moléculas de transporte circulatorio de lípidos, hormonas, vitaminas y metales. También sirven como enzimas, componentes del complemento, inhibidores de la proteasa y precursores de la quina. Las proteínas séricas desempeñan un papel importante en la regulación de la actividad y el funcionamiento acelular y en el sistema inmunitario. La separación de las proteínas séricas mediante electroforesis es una valiosa herramienta de diagnóstico, así como una forma de controlar la evolución clínica.
El 60% de las proteínas plasmáticas están formadas por la proteína albúmina, que es la que más contribuye a la presión osmótica del plasma, lo que ayuda al transporte de lípidos y hormonas esteroides. Las globulinas constituyen el 35% de las proteínas plasmáticas y se utilizan en el transporte de iones, hormonas y lípidos, ayudando a la función inmunitaria. El 4% es fibrinógeno y es esencial en la coagulación de la sangre y puede convertirse en fibrina insoluble. Las proteínas reguladoras, que constituyen menos del 1% de las proteínas plasmáticas, son proteínas como enzimas, proenzimas y hormonas. La investigación actual sobre las proteínas plasmáticas de la sangre se centra en la realización de análisis proteómicos del suero/plasma en busca de biomarcadores. Estos esfuerzos comenzaron con la electroforesis bidimensional en gel[1] en la década de 1970 y, en tiempos más recientes, esta investigación se ha llevado a cabo utilizando la proteómica basada en LC-tandem MS[2][3].